Одна из причин краха неодарвинизма — это несостоятельность идеи о том, что вся необходимая информация для построения животного содержится в его ДНК.
«Центральная Догма» нео-дарвинизма (Синтетическая Теория Эволюции) гласит, что все черты фенотипа биологических существ хранятся в их ДНК. Другими словами, чтоб изменить животное, либо растение, нужно изменить его ДНК. Все необходимые вариации происходят в ДНК и их сегментах — генах, а наихудшие из них устраняет естественный отбор, оставляя наиболее приспособленных. В 1950-х годов Уотсоном и Криком был открыт код ДНК, состоящий из четырех единиц (нуклеотиды) — Аденин (А), Гуанин (G), Цитозин (С), Тимин (Т).

Триплеты (три комбинации этих нуклеотидов) кодируют и соответствуют какому-то определенной аминокислоте, аминокислоты выстраиваются в цепочки и сворачиваются в белки — строительные элементы всего живого. Так, согласно нео-дарвинизма происходит эволюция живых организмов. Эти идеи преподносятся в книгах Ричарда Докинза, Билла Найа и Джерри Коена — популяризаторов неодарвинизма.
Однако, всё обстоит не так. Ученые довольно давно стали отмечать, что, помимо генетического кода, определяющего последовательность белка, существуют и иные нуклеотидные коды, регулирующие некоторые клеточные процессы, но не строящие аминокислотную последовательность (некодирующая ДНК). Но и это далеко не всё. Помимо разных регуляторных кодов ДНК, существуют так же внегенетические коды, также называемые онтогенетическими кодами или эпигенетическими. Другими словами, можно мутировать ДНК хоть миллионы лет, но мы не получим при этом новых форм тела животных, потому как информация об этом просто не содержится в ДНК. Всё это в корне противоречит центральной догме Синтетической Теории Эволюции.
Гены вообще не определяют:
- Пространственно-временное размещение белков в клетке и вне ее.
- Форму тела и размещение органов в теле (почему печень занимает свое место, а почему почки — своё).
Что касается, генетических кодов, то их множество. Большинство из них накладываются друг на друга и несут при этом независимые инструкции. Некоторые коды читаются спереди назад и задом наперед в то же время.
Некоторые коды расшифрованы, некоторые еще нет.
- Код перевода рамки триплета. Регулирует правильный подсчет триплета нуклеотидов рибозомой во время синтеза белка.
- Код апоптоза. Программирует и регулирует клеточную гибель. (Basañez and Hardwick 2008; Füllgrabe et al. 2010).
- Код преобразования сигналов. (Marcello Barbieri (2003). The Organic Codes: An Introduction to Semantic Biology).
Коды, не содержащиеся в ДНК, но, определяющие фенотип. Так же называются онтогенетическими кодами или эпигенетическими:
Многочисленность внегенетических кодов и информационных источников, регулирующих черты биологических существ подтверждает тот факт, что ген-центризм, популяризированный Докинзом недостоверен. Гены — это просто сырой материал и библиотека данных, которые клетки использует по своему назначению и нуждам. Помимо этого, довольно большой перечень морфологических качеств биологических организмов вообще не зависит от рекомбинации ДНК, потому как информация о них в ДНК просто не содержится.